在探讨论文查重是否有最佳时间的问题之前，我们首先需要明确论文查重的目的和意义。论文查重系统通过对论文进行检测，识别并标示出论文中存在抄袭、引用等学术不端行为的部分，帮助作者发现并纠正这些问题，从而提高论文的质量和原创性。因此，对于即将完成或已经完成初稿的作者来说，尽早进行论文查重，有利于及时发现和纠正学术不端行为，提高写作效率。

其实是一个因人而异的问题，因为每个人的写作进度、时间安排以及学术规范意识都有所不同。然而，根据大多数情况，我们可以给出一些普遍适用的建议：

一、初稿完成阶段：这是大多数作者通常会进行查重的阶段。此时，作者已经完成了论文的初稿，并希望通过查重系统来检测出论文中可能存在的抄袭、引用不当等问题，以便及时纠正。一般来说，初稿完成后的几天到几周内进行查重都是可以的。不过，如果时间过长，可能会导致作者忘记某些内容，或者论文内容有所变化，从而影响查重的准确性和有效性。

二、修改完善阶段：如果作者发现初稿中存在较多问题，需要进行修改和完善，那么在修改过程中进行查重也是非常有必要的。此时，作者可以根据查重报告中的结果，有针对性地进行修改，从而提高论文质量。一般来说，修改完善阶段的查重时间可以在修改工作的开始阶段，也就是论文写作的中间阶段进行。

三、答辩前阶段：对于一些即将毕业的学生来说，答辩前进行一次查重也是非常有必要的。一方面，学校通常会在答辩前要求提交论文的最终版本进行查重，以确保论文的原创性和质量；另一方面，通过查重也可以让作者对自己的论文有一个更全面的了解，发现可能存在的问题，以便在答辩前进行最后的修改和调整，答辩前的几周到一个月进行查重是比较合适的。

论文查重是否最佳时间因人而异，需要根据作者的实际情况和进度进行合理安排。初稿完成阶段、修改完善阶段以及答辩前阶段都是可以进行查重的时机，但需要注意时间间隔和准确性。无论何时进行查重，都需要确保查重系统能够准确识别和标示出论文中存在的抄袭、引用等学术不端行为的部分，帮助作者提高论文质量。